Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.8 ms