Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PKD2Q13563 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms