Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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TUBB3Q13509 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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TUBB3Q13509 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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TUBB3Q13509 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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TUBB3Q13509 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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TUBB3Q13509 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUBB3Q13509 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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