Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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