Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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