Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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