Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 338.3 ms