Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAPPC9Q96Q05 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms