Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN21Q16825 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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