Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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CNGA3Q16281 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGA3Q16281 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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