Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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