Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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