Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MEIS1O00470 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MEIS1O00470 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MEIS1O00470 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MEIS1O00470 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MEIS1O00470 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MEIS1O00470 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MEIS1O00470 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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