Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
OTOP3Q7RTS5 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.3 ms