Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD1Q16676 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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