Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
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NEDD8Q15843 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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NEDD8Q15843 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
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NEDD8Q15843 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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NEDD8Q15843 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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