Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL19A1Q14993 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL19A1Q14993 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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COL19A1Q14993 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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COL19A1Q14993 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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COL19A1Q14993 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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COL19A1Q14993 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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COL19A1Q14993 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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COL19A1Q14993 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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COL19A1Q14993 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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COL19A1Q14993 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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COL19A1Q14993 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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COL19A1Q14993 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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COL19A1Q14993 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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COL19A1Q14993 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL19A1Q14993 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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