Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCINQ13939 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCINQ13939 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCINQ13939 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCINQ13939 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCINQ13939 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCINQ13939 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCINQ13939 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCINQ13939 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCINQ13939 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCINQ13939 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCINQ13939 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCINQ13939 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCINQ13939 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCINQ13939 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCINQ13939 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCINQ13939 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CCINQ13939 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCINQ13939 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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CCINQ13939 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCINQ13939 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCINQ13939 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCINQ13939 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCINQ13939 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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CCINQ13939 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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