Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HDAC1Q13547 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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