Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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TUBB3Q13509 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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TUBB3Q13509 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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TUBB3Q13509 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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TUBB3Q13509 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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TUBB3Q13509 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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TUBB3Q13509 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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TUBB3Q13509 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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TUBB3Q13509 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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TUBB3Q13509 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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