Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
TUSC3Q13454 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TUSC3Q13454 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TUSC3Q13454 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUSC3Q13454 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUSC3Q13454 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUSC3Q13454 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUSC3Q13454 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUSC3Q13454 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUSC3Q13454 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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