Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTK7Q13308 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTK7Q13308 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms