Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170 ms