Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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