Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD11P31277 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD11P31277 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD11P31277 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD11P31277 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD11P31277 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD11P31277 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXD11P31277 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD11P31277 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
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