Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
APCP25054 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.6 ms