Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF5O14894 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TM4SF5O14894 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 523.8 ms