Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ERVV-2B6SEH9 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-2B6SEH9 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-2B6SEH9 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.5 ms