Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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