Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.5 ms