Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms