Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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VPS72Q15906 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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VPS72Q15906 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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VPS72Q15906 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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VPS72Q15906 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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VPS72Q15906 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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VPS72Q15906 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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VPS72Q15906 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
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VPS72Q15906 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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