Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SKIV2LQ15477 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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