Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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