Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NCAPHQ15003 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NCAPHQ15003 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NCAPHQ15003 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NCAPHQ15003 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCAPHQ15003 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCAPHQ15003 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCAPHQ15003 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCAPHQ15003 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCAPHQ15003 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NCAPHQ15003 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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