Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
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