Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
SMAD4Q13485 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SMAD4Q13485 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SMAD4Q13485 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SMAD4Q13485 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SMAD4Q13485 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMAD4Q13485 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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