Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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CLN3Q13286 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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