Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms