Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SEMA3BQ13214 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SEMA3BQ13214 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SEMA3BQ13214 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
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SEMA3BQ13214 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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SEMA3BQ13214 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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