Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms