Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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ZNF548Q8NEK5 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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ZNF548Q8NEK5 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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ZNF548Q8NEK5 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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ZNF548Q8NEK5 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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ZNF548Q8NEK5 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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