Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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PTPRNQ16849 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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PTPRNQ16849 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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PTPRNQ16849 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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PTPRNQ16849 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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PTPRNQ16849 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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PTPRNQ16849 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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PTPRNQ16849 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPRNQ16849 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPRNQ16849 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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PTPRNQ16849 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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PTPRNQ16849 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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