Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ZFHX3Q15911 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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