Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
UBE4AQ14139 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
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UBE4AQ14139 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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