Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SPTAN1Q13813 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPTAN1Q13813 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
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