Protein–RNA interactions for Protein: Q13671

RIN1, Ras and Rab interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN1Q13671 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RIN1Q13671 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RIN1Q13671 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms