Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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