Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
CSTF3Q12996 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms