Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD11P31277 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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